元代至1923年，为都里制。清雍正十三年（1735）析置荣成县前，文登县设7都69里；析置荣成县之后，设6都50里1318村。清光绪二十四年（1898），英国强租威海卫345村，文登县设5都973村。1924年改都为区。1930年，设5区28镇123乡1047村。1936年，全县设5区27镇17乡。1940年6月，抗日民主政府第四区东部置第六区，全县设6区41乡；同年12月取消乡级建置。1941年2月，全县设8区61乡；同年12月再次取消乡建置，文登县设12区321个行政村；文西县设13区253个行政村。1952年初，文登县设15区158乡镇；昆嵛县设15区137乡镇。1956年12月，合并后的文登县设10区64乡镇。1958年9月，全县成立21处人民公社。1959年7月，取消乡建置。1966年4月，全县设23处人民公社941个生产大队4380个生产队。1982年，文城人民公社改为城关镇。1984年3月，原23处公社改为9镇14乡，952个村。1989年12月，草庙子、侯家、小观、界石、晒字、蔄山、铺集和米山8乡改为镇，全市设17镇6乡952村。1992年5月，泽库、口子、张家产、天福山4乡改为镇。1992年8月，成立文登经济技术开发区（经济区划单位，经济技术开发区管理委员会为派出机构）。1993年10月，文登营、黄岚2乡改为镇，黄岚更名北郊。至此，全市设23镇952村。

1994年6月，草庙子、初村2镇划入威海市环翠区，文登市辖1区21镇872村。是年9月，设立双龙街道办事处，辖属13村改为居民区。1998年8月，撤销香水庵等31个村委会，以原村为基础改为31个居委会，仍以文城镇政府管理为主，业务受城市居民管理委员会指导。全市有21镇44个居民区828个村。

2001年5月，撤销文城镇，设立龙山路、天福路、环山路3个街道；北郊、晒字、铺集、天福山、口子、埠口镇，分别并入蔄山、界石、葛家、文登营、大水泊、张家产镇；经济技术开发区辖属双龙街道更名为文登经济技术开发区街道；原44个居委会改为社区居委会，并增加凤凰台、横山、大观园、五龙、西溪、双桥、北山、德贤、香山、学府、峰山、棋山、桃园、温泉、文星、爬山、秀山、豹山、南山19个社区居委会。全市设4个街道14个镇63个社区828个村。

2002年7月，设立双龙社区。2003年2月，撤销经济开发区街道，双龙等14个社区隶属经济开发区；4月，撤销凤凰台社区，设立西凤凰台社区，隶属龙山路街道；设立东风凰台社区，又析文登营镇漩夼村，隶属经济开发区；7月，经省政府批准，蔄山镇的北陡埠和王埠庄村划归龙山路街道。2005年2月，成立埠口港管理委员会（派出机构），辖8个村，1个社区委员会。10月，文登营镇的柳家庄、单鲍产、柏果树、上夼岭4个村划归经济开发区。2006年龙山街道的金岭屯村并入西楼社区。2007年6月，龙山街道、天福路街道、环山路街道更名为龙山街道、天福街道、环山街道。2008年4月，经威海市政府决定，汪疃镇（58村）、蔄山镇（65村3居）划归威海工业新区管理，未形成法律意义上的行政区划变动。12月，为适应社区建设需要，市政府决定将城区区规模进行调整，将城区21个社区居委会合并为10个。

2010年根据城市建设规划和南海新区发展需要，新成立4个社区居委会。12月，龙山街道吴家庵村并入西楼社区居委会。至2012年年末，全市有3个街道、12个镇、684个村，79个社区（不包括汪疃、蔄山2镇）。

2014年3月18日，经国务院批准，威海市文登区正式成立，以原文登市（不含汪疃镇、蔄山镇）的行政区域为文登区的行政区域，将原文登市的汪疃镇、蔄山镇划归威海市环翠区管辖。7月，泽头镇小洼村与北庄合并，沿用北庄村名；同时，在镇驻地东侧南海太阳城居民小区设立太阳城社区。2015年1月，经文登区批准，成立文登经济开发区金山管理委员会。2016年11月，大水泊镇庆合社区、界石镇昆龙社区撤销。2018年1月，经文登区政府常务会议研究同意，将13个城市社区和1个镇属东城社区调整为26个；4月，成立南海新区，代为管理小观镇53个村、1个社区；5月，天福街道孙家卧龙村、架子山村撤销，并入文昌社区。

2019年8月，宋村镇成立昌阳社区；8月，经文登区人民政府批准，龙山街道撤销11个“村改居”社区并入城市社区，天福街道撤销9个“村改居”社区并入城市社区，环山街道撤销12个“村改居”社区并入城市社区，金山管委撤销18个“村改居”社区并入城市社区。2020年9月27日，界石镇黄山村更名为昆嵛山村；10月，经文登区批准撤销文登经济开发区金山管理委员会，成立区金山综合服务中心，在区化工产业园发展中心挂牌。2021年3月，经文登区人民政府批准，天福街道撤销6个“村改居”社区并入城市社区，环山街道撤销4个“村改居”社区并入城市社区，撤销张家产镇埠口社区、宋村镇昌阳社区和泽头镇太阳城社区。   2021年8月24日，经文登区人民政府批准，将26个城市社区调整为47个城市社区。2022年7月，区金山综合服务中心在由区化工产业园发展中心挂牌调整为单独设置，未形成法律意义上的行政区划变动。2024年1月29日，经威海市委、市政府批准，威海南海新区管理委员会为威海市委、市政府派出机构，由文登区代管，不明确机构规格，依法依规行使赋予的经济管理权限，代管小观镇。

2024年年末，文登区辖3个街道12个镇718个村居（社区），其中村民委员会666个，社区居民委员会52个。